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有六种已知的流产类别：染色体、解剖学、免疫学、传染性、卵子质量和未知。在所有流产中，接近 50% 属于未知类别。尽管如此，那些经常流产的人仍然有希望。
染色体
染色体异常可由父母一方或双方携带。如果这些异常传递给发育中的胎儿，就有可能导致流产。这些异常可以通过血液检查在父母身上检测到，并且无法纠正。然而，一旦发现染色体异常，准父母之一或双方可以通过遗传咨询来评估他们未来成功怀孕的机会。
此外，可以使用胚胎植入前遗传学诊断 (PGD)。使用 PGD，可以在进行体外受精 (IVF) 后测试胚胎的已知遗传异常。只有染色体正常的胚胎才会被转移到子宫，试图实现不受染色体异常影响的妊娠。
解剖学
被视为解剖学流产的原因包括子宫和宫颈异常。例如，如果子宫在其腔内有壁（也称为隔膜），胚胎植入将更加困难并且可能会发生流产。子宫肌瘤和先前手术的变化（如疤痕形成）也可能导致流产。然而，这些情况可以通过手术治疗，这可能会大大增加足月妊娠的可能性。
在子宫内暴露于己烯雌酚 (DES) 的女性中也可以看到解剖异常。不幸的是，这些异常无法纠正，但可以采取措施增加那些暴露于 DES 的人成功怀孕的机会。
对于解剖学原因导致复发性流产的女性，手术选择可大大改善预后。例如，如果患者有子宫中隔，则不经治疗而流产的几率为 70%。然而，一旦通过手术矫正，她的流产几率就会恢复到没有异常的情况。
免疫学
虽然作为流产的原因有些争议，但免疫学问题，例如在患有风湿病（如狼疮或类风湿性关节炎）的女性身上看到的抗体问题，可能与流产有关。有证据表明，低剂量阿司匹林和肝素治疗可以改善携带这些抗体的女性的妊娠结局。这种针对免疫因素的治疗成功的可能性接近 60%。
传染性
子宫颈和子宫的感染也会增加流产的机会。幸运的是，感染可以很容易地通过培养诊断出来，也很容易用抗生素治疗。
卵子质量或卵巢储备
随着女性年龄的增长，卵子质量不断恶化。卵子质量差可能与流产率增加有关。出于这个原因，生育专家经常建议女性在月经周期中进行卵巢储备功能测试。在卵巢储备测试中，血液在第三个周期进行测试，并使用超声波来计算窦（静息）卵泡的数量。这些测试可以帮助评估女性是否丢失了优质卵子以及这种丢失的严重程度。
不明原因的流产
有过两次或两次以上流产的人中，将近 50% 没有可识别的原因。研究表明，如果夫妻经历过以前的流产，下一次怀孕的成功几率大约为 60% 到 70%。未能确定问题并不会自动结束无望的情况。情况可能正好相反；如果没有可识别的流产原因，夫妇可能仍有极好的机会在未来成功怀孕。
